明朝玄衣衛組織遭陷害解散數年后，過陰堂借機崛起作亂。皇城神樞營侍衛接連失蹤引發皇帝震怒，被特命調查的玉麒麟表面追查實則暗中操控局勢。前玄衣衛指揮使高建斌獨闖北鎮撫司，在擊退黑衣殺手的過程中發現玉麒麟竟是過陰堂安插在朝廷的臥底首腦。隨著調查深入，玄衣衛舊部逐漸集結重創過陰堂據點，揭露其意圖通過復活上古妖獸顛覆大明江山的驚天陰謀。最終正邪雙方在紫禁城展開決戰，雖成功阻止妖獸現世卻付出慘重代價，幸存者得以重建玄衣衛體系。